Cогласно Уставу МБОУДО "ДООЦ "Бригантина" г. Чебоксары управление Учреждением осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации, иными нормативными правовыми актами, настоящим Уставом и строится на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Единоличным исполнительным органом Учреждения является директор, назначаемый на должность и освобождаемый от должности в соответствии с муниципальными правовыми актами муниципального образования города Чебоксары - столицы Чувашской Республики, который осуществляет текущее руководство деятельностью Учреждения.
Директор подотчетен Управлению образования администрации города Чебоксары.